通过基因转换系统和基于AlphaFold模型的分子对接,探索Botrytis cinerea中的SDHI真菌杀菌剂耐药性
Haifeng Liu1, Gahee Lee1, Hyunkyu Sang1,2,3
1Department of Integrative Food, Bioscience and Biotechnology, Chonnam National University, Gwangju, Republic of Korea.
Pest management science
|July 26, 2024
概括
在韩国草中发现了灰色菌 (Botrytis cinerea) 对酸脱酶抑制剂 (SDHI) 杀菌剂的高耐药率. 在SdhB和SdhC基因中的基因突变是驱动这种真菌杀菌剂耐药性的关键机制.
科学领域:
- 农业科学 农业科学
- 植物病理学 植物病理学
- 菌类遗传学 菌类遗传学
背景情况:
- 由Botrytis cinerea引起的灰是一种主要的草疾病.
- 酸脱酶抑制剂 (SDHI) 杀菌剂对于疾病控制至关重要.
- 了解B. cinerea耐药机制对于有效的疾病管理至关重要.
研究的目的:
- 为了监测Botrytis cinerea对韩国草中SDHI杀菌剂博斯卡利德的耐药性.
- 调查B. cinerea.中SDHI真菌杀菌剂耐药性的基因机制.
- 确定不同Sdh基因型对各种SDHI的敏感性概况.
主要方法:
- 来自韩国草的B. cinerea分离物的耐药性监测 (2020-2021年).
- 使用遗传分析识别SdhB和SdhC基因中的突变.
- 在体外和体内测定六种SDHIs的敏感性概况.
- 用AlphaFold模型对突变和分子对接试验进行遗传验证.
主要成果:
- 在B. cinerea. 中观察到对博斯卡利德的高耐药率 (2020年为76.92%,2021年为72.25%).
- 在SdhB中,主导突变P225F/H和H272R在耐药菌株中被发现.
- 在敏感菌株中发现了SdhC (G85A,I93V,M158V,V168I) 的同时突变.
- 敏感性概况与已识别的Sdh基因型相关.
结论:
- 在韩国草种植中,Botrytis cinerea对SDHI杀菌剂表现出显著的耐药性.
- 在SdhB和SdhC中的基因突变是SDHI耐药性的主要驱动因素.
- 这项研究提供了对其他真菌病原体适用的杀菌剂耐药机制的见解.
