使用有机物衍生小鼠模型和单核RNA测序的胰腺瘤微环境特征的协议
Muntadher Jihad1, Gianluca Mucciolo1, Wenlong Li1
1University of Cambridge, Cancer Research UK Cambridge Institute, Li Ka Shing Centre, Robinson Way, CB2 0RE Cambridge, UK.
STAR protocols
|July 26, 2024
概括
这项研究介绍了小鼠模型胰腺瘤单核RNA测序 (snRNA-seq) 的协议. 该方法可以从具有挑战性的组织中进行基因表达分析,有助于癌症研究.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 单核RNA测序 (snRNA-seq) 对于分析复杂组织中的基因表达至关重要.
- 胰腺瘤对传统的单细胞解离方法构成挑战.
- 器官衍生小鼠模型为研究瘤生物学提供了一个相关的平台.
研究的目的:
- 建立和详细介绍一项用于从胰腺瘤中生成单核RNA测序 (snRNA-seq) 数据的协议.
- 为了使胰腺瘤的综合基因表达概况使用snRNA-seq.
- 为研究人员提供可复制的方法,使用有机物衍生小鼠模型工作.
主要方法:
- 建立有机物衍生的小鼠模型,与正确移植的胰腺瘤.
- 从冷或难以分离的胰腺瘤组织中分离单个核.
- 应用snRNA-seq在单核水平上对基因表达进行分析.
主要成果:
- 从胰腺瘤中成功生成高质量的snRNA-seq数据.
- 提供了详细的样本准备和数据采集协议.
- 该协议适用于来自有机体的异种移植模型.
结论:
- 描述的协议有助于对胰腺瘤进行可靠的snRNA-seq分析.
- 这种方法增强了对瘤异质性和细胞动态的研究.
- 它为使用先进的小鼠模型进行胰腺癌研究提供了宝贵的工具.
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