通过单细胞和批量转录组的综合分析,探索中性粒细胞相关基因在骨髓瘤中的作用
Jing Lu1,2, Jiang Rui2, Xiao-Yu Xu2
1Department of Radiology, The Second Affiliated Hospital of Soochow University, Suzhou 215025, China.
Biomedicines
|July 27, 2024
概括
与中性粒细胞相关的基因 (NRG) 与更好的骨髓瘤预后有关. 一个新的NRG签名有助于预测结果和指导骨髓瘤患者的治疗.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 中性粒细胞相关基因 (NRG) 在骨髓瘤 (OS) 中的参与仍未得到充分探索.
- 了解NRG对于OS预后和瘤微环境 (TME) 描述至关重要.
研究的目的:
- 调查NRG与骨髓瘤预后之间的关联.
- 探索NRGs在OS瘤微环境中的作用.
主要方法:
- 分析了来自TARGET-OS和GEO数据库的数据.
- 提取了与中性粒细胞相关的基因 (NRG),并使用拉索分析识别了枢纽基因,以创建NRG签名.
- 预后值通过卡普兰-梅尔分析和ROC曲线进行评估;TME和免疫调节剂使用GSEA,GSVA和ssGSEA进行评估.
主要成果:
- 确定了FCER1G和C3AR1作为骨髓瘤整体存活时间的预后生物标志物.
- 较高的NRG得分与降低的免疫调节剂,肌/免疫/ESTIMATE得分以及免疫细胞透相关.
- SPI1被确定为调节中心基因的关键转录因子;与FCER1G和C3AR1.1相关的KEGG中性粒细胞信号通路激活.
结论:
- 中性粒细胞在骨髓瘤瘤免疫微环境 (TIME) 中发挥着重要作用.
- 开发的NRG签名为评估骨髓瘤预后和告知治疗策略提供了有价值的工具.


