在果园中土壤微生物群落受到果菌病影响

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 土壤微生物学 土壤微生物学
• 菌类基因组学 菌类基因组学

背景情况:

• 干燥是一种破坏性类血管疾病,由真菌 *Plenodomus tracheiphilus* 引起.
• 土壤中受感染的植物残渣作为根部感染的主要来源,启动疾病传播.

研究的目的:

• 调查受MAL SECCO.影响的果园中的土壤细菌和真菌群落.
• 了解马尔塞科病对土壤微生物组合和多样性的影响.

主要方法:

• 采集了土壤样本,来自意大利西西里岛的五个受MAL SECCO影响的果园.
• 通过qPCR提取了总基因组DNA,用于通过qPCR量化真菌DNA.
• 细菌和真菌群落分别使用16S和ITS安普利康高通量测序进行了分析.
• 进行了贝塔多样性分析和核心社区分析,以评估微生物社区结构.

主要成果:

• 在所有采样的果园中检测到Plenodomus tracheiphilus*的真菌DNA.
• 在果园中观察到细菌和真菌社区组成的显著差异.
• 主导的细菌系包括蛋白质细菌,动态细菌和酸性细菌,其丰度波动不定.
• 阿斯科米科塔是占主导地位的真菌类,其中巴西迪奥米科塔和莫蒂埃罗米科塔的丰度可变.
• 假定有益细菌在受感染的土壤样本中显著丰富,表明复杂的微生物相互作用.

结论:

• 在果园中,土壤微生物组的组成有显著的变化,而果园中则有MAL SECCO感染.
• 感染土壤中有益细菌的丰富表明,它们可能在疾病调节或弹性方面发挥作用.
• 对这些微生物相互作用的进一步研究可以为管理类植物中mal secco疾病的策略提供信息.