发展一个光微卫星标记剂测定Pitaya癌症病原体 (Neoscytalidium dimidiatum) 的发展

科学领域:

• 植物病理学 植物病理学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 由*Neoscytalidium dimidiatum*引起的皮塔亚瘤对皮塔亚产业构成重大威胁.
• 以前的研究集中在生物特征和化学控制上,缺乏群体遗传学的分子工具.

研究的目的:

• 开发用于 *N. dimidiatum* 种群遗传学的多态微卫星标记物.
• 为了实现有效的基因型鉴定和分化病原体分离物.

主要方法:

• 组装了一个 *N. dimidiatum* (41.46 MB,9863个编码基因) 的基因组草案.
• 研究了微卫星序列,并重新测序了五个额外的分离物.
• 选了八对多态微卫星原料.
• 基因型化13个分离物以验证标记物多态性.
• 为35个隔离区建造了一个邻近的树.

主要成果:

• 成功开发了八个多态微卫星标记器.
• 标记物有效地区分了N. dimidiatum*分离物.
• 这些标记物显示出足够的基因型定型能力用于人口研究.

结论:

• 已经开发了一组多态微卫星标记器,用于*N. dimidiatum*.
• 这些标记物是皮塔亚瘤病原体的种群遗传学研究的宝贵工具.