用同位素标记生物质进行同位素稀释:对于定量代谢学来说,这是一个有效的替代方案
Veronika Fitz1, Lisa Panzenboeck1, Harald Schoeny2
1University of Vienna, Faculty of Chemistry, Institute of Analytical Chemistry, Waehringer Str. 38, 1090, Vienna, Austria; University of Vienna, Vienna Doctoral School in Chemistry (DoSChem), Waehringer Str. 42, 1090, Vienna, Austria.
Analytica chimica acta
|July 27, 2024
概括
本研究描述了用于定量代谢学的酵母衍生内部标准 (IS). 使用这些标准的单点校准提供了与多点校准可比的结果,节省了时间和资源.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 分析化学 分析化学
- 生物化学 生化学
背景情况:
- 定量代谢学依赖于使用内部标准 (IS) 从完全标记13C的生物质进行同位素稀释.
- 具有已知IS数量的样本的增量将特征要求降至最低,只需要对IS同位素丰富的实验性评估.
- 这项研究通过表征代谢物度和比较校准方法来增强酵母衍生IS工具箱.
研究的目的:
- 在酵母发酵批次中描述水友性代谢物的度水平.
- 探索一点IS与多点外部校准的优点分析数据.
- 为了验证酵母衍生的内部标准对定量代谢学的有用性.
主要方法:
- 在几个月内利用了独立的反向同位素稀释实验.
- 采用不同的染色学方法进行代谢物分析.
- 鉴定了83种13C标记的代谢物,用于度和不确定性.
主要成果:
- 成功描述了83种13C标记的代谢物,其度跨越5个数量级 (nM到mM).
- 酵母衍生IS表现出优异的中间稳定性 (92%,在5个月内间方法RSD≤30%).
- 一点内部标准化实现了相当于大多数代谢物的多点校准的优点数字.
结论:
- 拟议的校准工作流程简化了时间和标准支出,有利于广泛的目标测试和小批量测试.
- 这项研究为从高分辨率的MS数据中进行绝对量化和IS批次之间的无过渡奠定了基础.
- 进一步的发展旨在从档案MS数据进行绝对量化和简化生物质再校准.
