肠道细胞系HT29与Lacticaseibacillus共同培养的表观遗传景观
Anunay Sinha1,2,3, Sanjeev Khosla1,3
1Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics, Hyderabad, 500039, India.
Epigenomics
|July 29, 2024
概括
乳酸菌改变了人类肠道HT29细胞的表观遗传特征. 这种益生菌细菌修改了组素和m6AmRNA标记,影响了特定的遗传通路和基因表达.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 微生物学 微生物学
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 人的肠道微生物群在健康和疾病中起着至关重要的作用.
- 在表观遗传层面上了解宿主-微生物相互作用对于开发新型治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 研究Lacticaseibacillus共同培养对HT29人类肠道细胞表观遗传修饰的影响.
- 确定特定的表观遗传变化及其与基因表达变化的相关性.
主要方法:
- 在HT29细胞与Lacticaseibacillus的共同培养中.
- 通过使用ChIP-Seq和西部涂抹,分析基因组修饰 (H3K9ac,H3K4me3,H3K9me3).
- 通过直接mRNA测序评估m6AmRNA甲基化.
- 使用LC-MS识别Lacticaseibacillus的分泌体.
主要成果:
- 同培养导致H3K9ac和H3K4me3的全球丰富,以及HT29细胞中H3K9me3的枯竭.
- 表观遗传标记显示,基因转录起点 (TSS) 和上游区域的分布发生了变化.
- 在与特定基因通路相关的mRNA中,m6A甲基化模式被修改.
- 发现Lacticaseibacillus HU蛋白与海斯H3相互作用.
结论:
- 乳酸菌可以诱导人类肠道细胞的显著表观遗传变化.
- 这些修改影响了特定的遗传通路,这表明了益生菌介导的基因调节机制.
- 这些发现突显了Lacticaseibacillus在调节宿主细胞表观遗传学方面的潜力.


