在日本中对Hexabromocyclododecane的不一致的转录组反应:对四种不同研究设计的结果进行比较分析
Paul Béziers1, Elena Legrand1, Emily Boulanger1
1Faculty of Agricultural and Environmental Sciences, McGill University, Montreal, Québec, Canada.
Environmental toxicology and chemistry
|July 29, 2024
概括
用于毒性测试的转录组签名在不同的暴露方法和生命阶段之间存在显著差异. 这项研究发现,在测试阻燃剂hexabromocyclododecane (HBCD) 时,基因表达变化存在有限的重叠.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 基因组学就是基因组学.
- 化学安全评估 化学安全评估
背景情况:
- 转录学越来越多地用于毒性测试的新方法 (NAMs).
- 经典的毒性测试依赖于一致的,特征性的转录组签名.
- 对不同方法的转录基因反应进行比较分析对于监管机构的接受至关重要.
研究的目的:
- 调查日本的不同暴露场景和生命阶段对赫萨布罗摩环二甲 (HBCD) 的转录基因反应的一致性.
- 评估各种测试方法 (包括NAM) 产生的转录基因数据的可比性.
主要方法:
- 日本 (Coturnix japonica) 通过卵子注射 (生命早期阶段),口腔输液 (成年人) 和通过饮食暴露的母体转移 (生命早期阶段和化) 暴露于HBCD的次致命剂量.
- 对来自四个不同的暴露研究的肝脏组织进行了差异基因表达分析.
- 研究对差异表达基因 (DEG) 的数量和研究之间共享的DEG进行了比较.
主要成果:
- 在四项研究中检测到多种DEGs (范围从3到550).
- 在两个研究中,只有19个DEG是最重要的发现 (研究1和研究2).
- 剂量,暴露途径,生命阶段,采样时间和化学成分等因素影响了转录组反应.
结论:
- 在日本的不同测试方法和生命阶段中,对HBCD的转录组反应并未始终保持一致.
- 通过各种实验设计生成的转录组数据进行比较存在重大挑战.
- 需要进一步的研究来理解和标准化基于转录组学的毒性测试,以适用于监管应用.
