南非的 Bacillus anthracis,1975-2013:一些血统正在消失吗?
Kgaugelo Edward Lekota1,2, Ayesha Hassim3, Maphuti Betty Ledwaba3,4
1Faculty of Veterinary Science, Department of Veterinary Tropical diseases, University of Pretoria, Onderstepoort, 0110, South Africa. 37747959@nwu.ac.za.
BMC genomics
|July 30, 2024
概括
南非罕见的B类炭杆菌正在消失,现在爆发的疫情主要是由A类,特别是基因型A.Br.005/006. 这项研究证实了克鲁格国家公园中罕见的B类菌株的存在.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
背景情况:
- 炭杆菌 (Bacillus anthracis) 是炭病的致病原体,存在于A,B和C基因类.
- 南非克鲁格国家公园 (KNP) 历史上有B. anthracis的常见A类和罕见B类叶片.
- 在1991年之前,B类菌株在Pafuri (KNP) 占主导地位,A类菌株在中央占主导地位;然而,自1992年以来,只有A类菌株被隔离出来.
研究的目的:
- 用分子方法在南非特征Bacillus anthracis菌株.
- 调查KNP中B类菌株的流行率和遗传构成.
- 将KNP菌株与其他南非和全球B. anthracis基因组进行比较.
主要方法:
- 对319种B. anthracis菌株进行多部位变数串联重复分析 (MLVA-31).
- 从土壤和动物尸体中选择B类菌株的全基因组测序.
- 用公开可用的B. anthracis基因组进行比较基因组分析.
主要成果:
- 在1991年之前,KNP的B类菌株形成了两个主要的基因型.
- 南非菌株主要聚集在基因型A.Br.005/006中,在KNP和北开普省 (NCP) 发现.
- 在 B.Br.001 组合的罕见 B 类菌株得到证实,在 NCP 中与小类菌株 A.Br.001/002 和 A.Br.101 一起确认.
结论:
- 在南非,B类类菌株Bacillus anthracis似乎正在消失.
- 目前南非的炭病爆发主要是由A.Br.005/006基因型引起的.
- 这项研究证实了KNP中罕见的,正在消失的B类菌株的存在,突出显示了B. anthracis种群动态的变化.
关键词:
百日 (Bacillus anthracis) 是一种植物.双重重复 (VNTR) 试验的多位置变量数量MLVA-31-31全基因组测序 (WGS) 是一种全基因组测序.整个基因组的单核酸多态 (wgSNP)更多相关视频
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