PICKAPEP:一个应用程序用于参数计算和可视化循环和修改的peptidomimetics
Vanessa Erckes1, Mattis Hilleke2, Clemens Isert2
1Department of Chemistry and Applied Biosciences, Institute of Pharmaceutical Sciences, Laboratory of Pharmaceutical Analytics, ETH Zurich, Zurich, Switzerland.
概括
研究人员现在可以使用PICKAPEP,一种新的计算器工具,虚拟设计和分析修改过的. 该软件通过计算定制结构和库的关键分子性质,帮助类药物开发.
科学领域:
- 酸科学是一种科学.
- 计算化学是一种计算化学.
- 药物发现 药物发现
背景情况:
- 对改性和模仿剂的兴趣日益增长.
- 需要计算工具来帮助设计新结构.
- 现有的工具缺乏用于定制分析的全面功能.
研究的目的:
- 介绍PICKAPEP,一个多功能计算器用于虚拟peptidomimetic构建和可视化.
- 为研究人员提供一个工具来分析定制的基于的结构.
- 通过计算分析促进类药物开发.
主要方法:
- 开发了PICKAPEP软件应用程序.
- 实施虚拟构造和可视化型模拟学.
- 分子重量,分离系数,极地表面积,可旋转键和SMILES代码的计算.
主要成果:
- 皮卡佩普可以创建多种类型的模仿剂,从已知的化合物到完全定制的设计.
- 该工具计算的基本物理化学和拓参数.
- PICKAPEP支持添加非天然氨基酸和处理大型类库.
结论:
- PICKAPEP 是第一个允许定制氨基酸结合和库批处理的工具.
- 预计该软件将大大支持类研究人员和药物开发.
- PICKAPEP可用于Windows和Mac操作系统的开源.
