基于DNA元编码的综合检测,通过多基板方法在休码头中检测非本土无脊椎动物
Ana S Lavrador1, Fábio G Amaral1, Jorge Moutinho1
1Centre of Molecular and Environmental Biology (CBMA) and ARNET-Aquatic Research Network, Department of Biology, University of Minho, Campus de Gualtar, 4710-057, Braga, Portugal; Institute of Science and Innovation for Bio-Sustainability (IB-S), University of Minho, Campus de Gualtar, 4710-057, Braga, Portugal.
Marine environmental research
|August 1, 2024
概括
检测入侵性海洋物种需要多样化的采样. 结合水,动物浮游生物和基质样本,可以更好地检测非土著物种 (NIS) 和无脊椎动物的整体多样性.
科学领域:
- 海洋生物学 海洋生物学
- 环境DNA (eDNA) 分析
- 监测入侵物种的监测.
背景情况:
- 环境DNA (eDNA) 元编码是检测海洋非土著物种 (NIS) 的强大工具.
- 目前的方法通常依赖于过的海水,可能缺少隐秘或基质相关的NIS.
- 一个全面的监测策略可能需要评估多个采样基板.
研究的目的:
- 为了比较五种不同的采样基板 (硬基板,人工基板,水,动物浮游生物) 的有效性,以检测海洋无脊椎动物的多样性和NIS.
- 评估不同样本类型和时间点的物种和NIS的恢复率.
- 为了确定葡萄牙NIS的潜在新记录.
主要方法:
- 两个码头在三个时间点被监控.
- 收集了五种不同的样本类型:硬基板,人工基板,过的海水和动物浮游生物样本.
- 使用COI和18SrRNA基因标记物进行了DNA元编码.
- 检测到的物种和NIS在所有样本类型中进行了比较.
主要成果:
- 在所有样本中共检测到628个物种和23个NIS.
- 硬质和人造基板产生了最高的无脊椎动物恢复,显著超过水和动物浮游生物样本.
- 在所有样本类型中,只检测到很小一部分 (多达9%的物种,17%的NIS),这表明样本的变化很高.
- 五个NIS可能代表葡萄牙的新纪录.
- 在所有样本类型和季节均没有一致检测到NIS.
结论:
- 依靠单一的采样方法,如水eDNA,对于全面的海洋NIS监测是不够的.
- 将硬质和人工基质与水和动物浮游生物采样相结合,可以更好地检测海洋无脊椎动物的多样性和NIS.
- 多样化的采样方法和考虑季节性变化对于有效的海洋NIS监测计划至关重要.
