人类非阻塞性亚精子症中与cuproptosis相关的基因的比较跨平台分析:一项观察性研究

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 生殖医学 生殖医学

背景情况:

• 非阻塞性精症 (NOA) 是男性不育的主要原因之一.
• 细胞亡是一种受调节的细胞死亡形式,因其在各种病理中的作用而越来越受认可.
• 对NOA的生物标志物对于诊断和了解疾病机制至关重要.

研究的目的:

• 识别与非阻断性亚精子症 (NOA) 相关的新型杯亡相关基因.
• 根据cuproptosis生物标志物开发NOA的诊断和预后模型.
• 探索涉及NOA病原体中cuproptosis的潜在分子机制.

主要方法:

• 利用生物信息学分析多个NOA微阵列数据集从NCBI基因表达大盘.
• 应用最小绝对缩小和选择操作员 (LASSO) 回归和支持向量机-递归特征消除 (SVM-RFE) 来识别枢纽基因.
• 使用后勤回归构建了竞争的内源RNA (ceRNA) 网络和风险预测模型.

主要成果:

• 确定了10个与cuproptosis相关的基因的差异表达,随后选了6个枢纽基因:DBT,GCSH,NFE2L2,NLRP3,PDHA1和SLC31A1.1.
• 在NOA患者中验证了GCSH,NFE2L2,NLRP3,PDHA1和SLC31A1的高表达.
• 开发了一个具有高诊断准确性的6基因特征风险模型 (AUC 0.970在培训中,1.0在验证中).
• 发现了"同类重组"途径的显著丰富,并在ceRNA网络中确定了关键的microRNA (hsa-miR-335-3p,hsa-miR-1-3p).

结论:

• 已确定的6个与核亡相关的基因 (DBT,GCSH,NFE2L2,NLRP3,PDHA1,SLC31A1) 显示出作为NOA生物标志物的显著潜力.
• 这些基因及其相关途径可能在非阻塞性亚精子症的发病过程中发挥关键作用.
• 开发的风险预测模型证明了NOA诊断的高效性.