综合基因组学揭示了葡萄藤无种的多基因基础
Xu Wang1, Zhongjie Liu2, Fan Zhang2
1National Key Laboratory of Tropical Crop Breeding, Shenzhen Branch, Guangdong Laboratory of Lingnan Modern Agriculture, Key Laboratory of Synthetic Biology, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Agricultural Genomics Institute at Shenzhen, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shenzhen, China; School of Agriculture and Food Science, University College Dublin, Belfield, Dublin, Ireland.
葡萄中没有种子是多基因的,是由内向和Chr10.0的特定反转形成的. 这项研究确定了关键基因,并实现了高预测准确性,用于培育无种子桌面葡萄品种.
科学领域:
- 遗传学 遗传学 是一个
- 基因组学就是基因组学.
- 植物育种 植物育种
背景情况:
- 没有种子是食用葡萄的关键特征,但它的遗传基础和进化是复杂的.
- 了解种子流产的多基因性质对于葡萄的改善至关重要.
研究的目的:
- 揭开维蒂斯葡萄酒L.无种的进化和多基因基础.
- 识别与无种子相关的基因和基因组区域.
- 开发精确的基因组预测模型,用于无种子.
主要方法:
- 使用了比较基因组学,种群遗传学,定量遗传学和整合基因组学.
- 无种子品种的哈普洛型解析基因组被生成.
- 进行了全基因组关联研究 (GWAS) 和基于机器学习的基因组选择.
主要成果:
- 鉴定出了特定于无种子葡萄的~4.25 Mb 半形的 Chr10 逆转,其中包含关键基因.
- 无种性起源于"苏丹尼亚"并通过内入进化.
- 确定了110个定量特征位点 (QTL) 和339个与种子发育相关的核心候选基因.
- 机器学习实现了97%的无种子预测准确度.
结论:
- 葡萄无种是一种多基因特征,受到内进和染色体重组的影响.
- 这项研究为无种子葡萄的分子育种提供了有价值的候选基因.
- 高精度的基因组选择模型可以加速无种子桌面葡萄品种的繁殖.
更多相关视频
10:40Comprehensive Workflow for the Genome-wide Identification and Expression Meta-analysis of the ATL E3 Ubiquitin Ligase Gene Family in Grapevine
Published on: December 22, 2017
07:18Obtaining High-Quality Transcriptome Data from Cereal Seeds by a Modified Method for Gene Expression Profiling
Published on: May 21, 2020
相关概念视频
Monohybrid Crosses
Dihybrid Crosses
Incomplete Dominance
Seed Structure and Early Development of the Sporophyte
Genetics of Speciation
Epistasis Analysis
