评估废水中SARS-CoV-2的定量检测方法的不确定性:度,提取和放大

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 病毒学 病毒学
• 分子诊断学 分子诊断学

背景情况:

• 在废水中精确量化严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (SARS-CoV-2) 对公共卫生监测至关重要.
• 现有的方法面临着大量的不确定性,挑战可靠的病毒载荷确定.

研究的目的:

• 综合评估和优化废水中SARS-CoV-2量化方法.
• 为了确定最有效的度技术,核酸提取协议,以及用于精确病毒检测的原始探针集.

主要方法:

• 两种废水度方法 (超和PEG沉) 的比较分析.
• 对三种核酸提取方法的评估,包括一种强烈的珠子敲击方法.
• 对八个SARS-CoV-2初始探针组进行放大性能评估.

主要成果:

• 超过 (30 kDa截止值) 和PEG沉 (15% PEG,1.5 M NaCl) 显示了高的病毒恢复率 (约. 27%),量化不确定性降低.
• 强烈的珠子敲击 (6 m/s) 显著提高了病毒RNA提取产量 (高达82.18%).
• 在不同样本类型中,E_Sarbeco初级探头组表现出最稳定和最一致的定量性能.

结论:

• 优化的度和提取方法显著提高了SARS-CoV-2废水量化的准确性和可靠性.
• 推使用E_Sarbeco初始探头套件,用于在废水监测中进行准确和稳定的检测.
• 这些发现有助于建立可靠的协议,以有效监测SARS-CoV-2的环境.