空间免疫类型识别使用二级淋巴细胞组织中免疫毛囊的多重成像

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 细胞生物学 细胞生物学
• 生物物理学的生物物理.

背景情况:

• 二级淋巴体器官 (SLOs) 对于适应性免疫至关重要,但它们复杂的细胞架构和细胞外矩阵 (ECM) 组织仍然不明.
• 传统的成像技术在能够分析的标记物数量上是有限的,这阻碍了SLO中免疫细胞的全面空间分析.

研究的目的:

• 通过使用高复合成像,研究不同SLO中的免疫细胞和ECM的空间组织.
• 开发和应用一个计算工作流来详细的空间表型化大量的细胞.

主要方法:

• 利用25倍位成像质量细胞计,以以亚细胞分辨率在SLO组织中分析免疫,肌体,化学,表观遗传和功能标记物.
• 开发了*SpatialVizPheno*计算工作流程,用于对近一百万个细胞进行强大的细胞识别和空间表型化.
• 采用手动封锁,半监督封锁,代聚类,以及用于细胞分析的注释.

主要成果:

• 淋巴结 (LN) 的B细胞密度最高,而肠道组织的调节性和卵泡辅助性T细胞比例最高.
• 在淋巴状组织中发现了毛囊树突细胞,树突细胞 (SCs) 和等离子体/等离子体细胞之间的频繁相互作用.
• 观察到与桃体 (TS) 和LN中的B细胞毛囊空间相关的原丰富区域,但不在肠道淋巴组织中.

结论:

• 空间免疫类型和ECM组成在SLOs之间存在显著差异.
• 这些空间变异提供了关于细胞组织和免疫反应有效性之间的关系的见解.
• *SpatialVizPheno* 工作流允许对复杂组织微环境进行详细的空间分析.