结合性转录基因和单细胞蛋白质对结肠直肠癌的表征描述了与整体存活率相关的独特瘤免疫微环境
Erika Hissong1, Bhavneet Bhinder2, Junbum Kim2
1Department of Pathology and Laboratory Medicine, Weill Cornell Medicine, 525 E 68th St, New York, NY 10065; Englander Institute for Precision Medicine, Weill Cornell Medicine and New York Presbyterian, 413 E 69th St, New York, NY 10021, USA.
Research square
|August 7, 2024
概括
大肠直肠癌 (CRC) 呈现出不同的免疫微环境 (TIME). 激活的TIME与更好的预后相关,而抑制的TIME与CRC患者的生存结果较差有关.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 是一种复杂的疾病,患者的结局是可变的.
- 瘤免疫微环境 (TIME) 越来越多地被认可为其在CRC进展和治疗反应中的作用.
研究的目的:
- 研究结直肠癌患者的TIME组成和预后结果之间的相关性.
- 用先进的分子和空间生物学技术,在CRC TIME中描述不同的免疫表型.
主要方法:
- 在初级和转移性CRC样本上进行全外体测序和大量RNA测序.
- 免疫细胞解体,基因组丰富分析和无监督聚类.
- 使用成像质细胞测量方法对TIME进行单细胞分辨率空间分析.
主要成果:
- 确定了两个不同的CRC免疫表型:免疫激活和免疫抑制.
- 激活的TIME的特征是Th1细胞,树突细胞,三级淋巴体结构和CD8+T细胞的增加.
- 抑制的时间显示了巨细胞的增加和更高的M2/M1比率,与明显较低的整体存活率相关 (HR 1.66,p=0.007).
结论:
- 免疫微环境显著影响结直肠癌的进展和患者的预后.
- 描述TIME组合提供了对CRC异质性和患者结果的关键见解.
- 在CRC TIME中,不同的免疫状态具有预后影响,突出显示潜在的治疗点.
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