肺MAP下一代对高级状细胞肺癌的测序分析 (SWOG S1400)
David Kozono1, Xing Hua2, Michael C Wu2
1Department of Radiation Oncology, Dana-Farber Brigham Cancer Center, Boston, Massachusetts.
概括
下一代测序 (NGS) 确定了状细胞肺癌 (SqCC) 中相互排斥的基因变异. 与NFE2L2/KEAP1同时发生的PARP4变化,这表明在治疗耐药性方面发挥了作用.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 状细胞癌 (SqCC) 是一种肺癌亚型,具有有限的向治疗选择.
- 通过下一代测序 (NGS) 进行分子表征对于识别SqCC中的治疗点至关重要.
- 肺癌主协议S1400研究旨在识别之前治疗的IV期或复发性SqCC的生物标志物.
研究的目的:
- 使用NGS进行SqCC的分子表征.
- 确定SqCC.的潜在治疗点和生物标志物.
- 分析基因变异及其与SqCC患者生存的关联.
主要方法:
- 瘤样本使用基金会医学的FoundationOne平台进行了NGS,分析了313个与癌症相关的基因.
- 相互排斥的基因组分析和在人类瘤中由进化条件连接的选择事件被用来识别基因变异模式.
- 与癌症基因组图谱 (TCGA) 肺SqCC数据进行了比较,并且考克斯比例危险模型评估了生存相关性.
主要成果:
- 来自1672名S1400患者的NGS数据显示了两组相互排斥的变化:{NFE2L2,KEAP1,PARP4}和{CDKN2A,RB1}.
- PARP4 呈现出频繁的突变 (I1039T,Q1059R,T1170I),这表明其具有功能意义.
- NFE2L2和KEAP1的变化与较差的生存结果有关.
结论:
- S1400 NGS数据集代表了临床试验中SqCC最大的分子概况,作为生物标志物发现的宝贵资源.
- PARP4和NFE2L2/KEAP1变异之间的相互排他性表明,PARP4在影响氧化应激反应和治疗耐药性的途径中可能具有未经表征的作用.
