识别和表征与米饭饼中的盐度压力相关的miRNA和lncRNA
Conghui Jiang1, Yulong Wang2, Yanan He1
1Institute of Wetland Agriculture and Ecology, Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan 250100, China.
International journal of molecular sciences
|August 10, 2024
概括
这项研究揭示了竞争的内源RNAs (ceRNAs) 如何调节大米的盐分耐受性和产量. 它确定了关键的lncRNAs,miRNAs和mRNAs参与植物对盐度压力的反应.
科学领域:
- 植物分子生物学 植物分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 无生性压力生理学 生物压力生理学
背景情况:
- 盐度是一个主要的非生物压力,限制了作物生产率,特别是大米.
- 虽然已知微RNA (miRNA) 和长非编码RNA (lncRNA) 对盐度有反应,但竞争性内源RNA (ceRNA) 网络在米盐耐受性和产量中的作用仍未得到充分探索.
研究的目的:
- 为了研究ceRNAs在盐应激下大米的繁殖阶段的功能.
- 确定关键的监管要素和涉及提高耐受性和大米产量的途径.
主要方法:
- 在盐应激下对大米的全转录组测序.
- 对lncRNAs,miRNAs和mRNAs的差异表达分析.
- 一个lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络的构建.
- 监管相互作用的生物信息预测.
主要成果:
- 在盐应激下鉴定了214个差异表达的lncRNA,79个miRNA和584个mRNA.
- 功能丰富分析揭示了它们在应激反应,生物合成和代谢途径中的作用.
- 构建了一个ceRNA网络,其中有95个lncRNA-miRNA-mRNA三胞胎.
- 突出特定的lncRNAs (例如,MSTRG.51634.2,MSTRG.48576.1) 调节盐分耐受性和与产量相关的基因 (例如,OsMYB2,OsMADS63).
- 确定了调节压力的 lncRNA 和参与盐应激反应的水素蛋白.
结论:
- ceRNA网络在调解大米对盐应激反应和影响产量方面发挥着至关重要的作用.
- 特定的lncRNA及其点为培育耐盐米品种提供了潜在的遗传资源.
- 这项研究加深了对植物适应盐度的分子机制的理解.
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