整合Multi-Omics与环境数据的精确健康:一个新的分析框架和关于产前诱导的儿童脂肪肝疾病的案例研究
Jesse A Goodrich1, Hongxu Wang1, Qiran Jia1
1Department of Population and Public Health Sciences, University of Southern California, Los Angeles, CA, United States.
Environment international
|August 11, 2024
概括
产前暴露与儿童的肝酶水平较高有关,可能是通过DNA甲基化和基因表达变化. 这个精确的健康框架确定了代谢功能障碍相关的脂肪肝疾病 (MAFLD) 的生物标志物和高风险群体.
科学领域:
- 环境健康 环境健康
- 基因组学就是基因组学.
- 精准医学是一门精准的医学.
背景情况:
- 精密健康利用多种OMIC数据来预防疾病,但往往忽视了环境因素.
- 个性化的环境风险因素,如污染物,对于全面的健康评估至关重要.
研究的目的:
- 制定一个精确的卫生框架,整合多主题和调解方法.
- 确定生物标志物和分子途径,将产前暴露与儿童代谢功能障碍相关的脂肪肝疾病 (MAFLD) 联系起来.
- 使用综合暴露和多组数据识别高风险儿童.
主要方法:
- 420对母婴对的前性队列研究 (人类早期生命暴露体项目).
- 测量了产前暴露,儿童细胞激素18 (CK-18;MAFLD生物标志物) 和五个omics层 (DNA甲基化,基因转录,microRNA,蛋白质,代谢物).
- 应用多原子集成和调解分析 (高维,潜伏因素,集成/准调解).
主要成果:
- 产前的增加与儿童CK-18水平的升高有关.
- 确定了10个生物标志物 (CpG位点,转录) 链接产前和CK-18.
- 发现的分子通路 (细胞因子信号传递,肝星细胞激活) 和基于暴露,表观遗传学和MAFLD状态的高危子组.
结论:
- 产前暴露于会导致儿童肝酶升高,由表观遗传和基因表达变化介导.
- 开发的分析框架适用于各种精确的健康调查.
更多相关视频
17:28Human Pluripotent Stem Cell Based Developmental Toxicity Assays for Chemical Safety Screening and Systems Biology Data Generation
Published on: June 17, 2015
12.6K
05:44Author Spotlight: Collecting the Brain and Serum from the Same Mice Fetus to Study Brain Tumor Development
Published on: May 17, 2024
548
