数据,分析管道和结果的分布式协作在单细胞的Omics中.

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 计算生物学 计算生物学

背景情况:

• 单单细胞的数据分析管道是复杂的设计.
• 分享和复制这些管道是具有挑战性的.
• 缺乏可访问的工具阻碍了研究进展.

研究的目的:

• 为无代码单细胞omics分析管道设计引入一个网络平台.
• 为了方便简单的计算和管道,数据和结果的共享.
• 提高单细胞体质学研究的可访问性和可复制性.

主要方法:

• 开发一个基于网络的平台,用于直观的管道建设.
• 与开放科学网格进行集成,以实现可扩展计算.
• 功能可以共享整个分析管道,输入数据和交互结果.

主要成果:

• 该平台使用户能够在没有编码的情况下设计复杂的分析管道.
• 在分布式计算资源上实现管道的无执行.
• 提供了一个集中存储库,用于共享可重复的单细胞欧米克分析.

结论:

• 开发的平台显著降低了单细胞数据分析的进入障碍.
• 它促进了现场更大的透明度和可重复性.
• 预计通过使复杂的分析更容易获得,加速发现.