多omics景观揭示了长期COVID患者的异质性,其特点是中性粒细胞活性增强

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 基因组学就是基因组学.
• 蛋白质组学是指蛋白质组学.
• 传染病流行病学 传染病流行病学

背景情况:

• 奥米克朗变种的快速传播导致了大量的个体经历持续的症状,称为长期COVID.
• 驱动长期COVID的潜在分子和免疫机制,特别是在Omicron变种的背景下,由于患者异质性,人们对其了解甚少.

研究的目的:

• 为了研究Omicron感染后长期COVID患者的分子和免疫特征.
• 在长期COVID人口中识别潜在的生物标志物和患者子组.
• 为了探索长期COVID病变发生的异质性.

主要方法:

• 招募了66名参与者:22名健康对照,22名长期COVID (LC),22名没有长期COVID (NLC) 6个月的Omicron感染后.
• 评估了血中和抗体标位,SARS-CoV-2病毒载量,并进行了转录基因和蛋白质基因分析.
• 利用机器学习进行数据分析和识别不同的患者子组.

主要成果:

• 在6个月后,LC和NLC组之间没有观察到剩余的SARS-CoV-2或中和抗体标位的显著差异.
• 转录基因和蛋白质基因分析将长期COVID患者分为中性粒细胞功能上调 (NU-LC) 和下调 (ND-LC) 的分组.
• 在NU-LC小组中,中性粒细胞数量和脱粒功能较高,可通过5个基因标记物 (ABCA13,CEACAM6,CRISP3,CTSG,BPI) 识别,在12个月内恢复.

结论:

• 长期COVID表现出异质性,具有独特的子组,其特征是中性粒细胞激活.
• 在长期COVID中中性粒细胞的激活可能与精神症状和炎症加剧有关.
• 一个5基因签名作为这种中性粒细胞激活的长期COVID亚组的强有力的歧视,帮助治疗向和流行病学研究.