一种预测细胞增殖的转录基因生物标志物,用于不良结果途径信息测试和评估
J Christopher Corton1, Victoria Ledbetter1, Samuel M Cohen2
1Center for Computational Toxicology and Exposure, US Environmental Protection Agency, Research Triangle Park, NC 27711, United States.
概括
一个新的基因表达生物标志物准确地预测了人类和动物组织中的细胞增殖 (CP). 该工具有助于解释高通量转录组学数据,用于化学安全评估和了解癌症发展.
科学领域:
- 毒素基因组学 毒素基因组学
- 分子生物学分子生物学
- 生物标志物开发 生物标志物开发
背景情况:
- 高通量转录组学 (HTTr) 对于识别与不良结果相关的化学分子标至关重要.
- 细胞增殖 (CP) 是化学致癌的一个关键事件.
研究的目的:
- 构建和描述一种基因表达生物标志物,可预测细胞增殖状态.
- 通过各种条件验证生物标记物在人类和动物组织中的实用性.
主要方法:
- 开发了一种基于前列腺癌和雌激素受体激活MCF-7细胞上调调的基因的30基因生物标志物.
- 使用大量的基因表达特征汇编来测试生物标记物.
- 生物标志物性能与传统的CP标志物 (PCNA,Ki67,BrdU) 的比较.
主要成果:
- 这种生物标志物在308/367个人类瘤中发现了增加的CP与正常组织的比较.
- 它检测了动物对雌激素受体激活,部分肝切除和肝癌原暴露的反应中的CP变化.
- 该生物标志物还确定了在p53激活,激酶抑制剂治疗和正常发育过程中抑制的CP.
结论:
- 开发的基因表达生物标志物是评估细胞增殖状态的可靠工具.
- 它有效地解释HTTr数据流用于化学安全和致癌性研究.
- 这种生物标志物在人类和动物模型中证明了它在各种生物环境中的实用性.
