基于机器学习的QSAR模型用于预测五种常见微塑料的细胞毒性
Chengzhi Liu1, Cheng Zong1, Shuang Chen1
1College of Safety Science and Engineering, Nanjing Tech University, Nanjing, Jiangsu 210009, China.
Toxicology
|August 13, 2024
概括
机器学习模型使用定量结构-活性关系 (QSAR) 分析预测微塑料 (MP) 毒性. 颗粒大小是影响MP毒性的关键因素,有助于环境风险评估.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 计算毒理学计算毒理学
- 生物医学科学 生物医学科学
背景情况:
- 微塑料 (MP) 构成环境和健康风险.
- 预测MP的毒性对于风险评估至关重要.
- 机器学习 (ML) 为毒性预测提供了先进的计算工具.
研究的目的:
- 开发和评估基于ML的定量结构-活性关系 (QSAR) 模型,用于预测BEAS-2B细胞上的MP毒性.
- 确定影响MP毒性的关键特征.
- 评估开发模型的预测性能和适用性领域.
主要方法:
- 六个ML算法被用来构建QSAR模型.
- 模型性能使用R2值来评估训练和测试数据集的模型性能.
- 用嵌入式特征重要性 (EFI),递归特征消除 (RFE) 和夏普利添加式扩展 (SHAP) 来确定特征的重要性.
- 威廉姆斯图形分析被用来评估模型适用性领域.
主要成果:
- 极端梯度增强模型显示出优异的预测性能 (R2_tra = 0.9876,R2_test = 0.9286).
- 所有六种开发的模型都在它们的适用性领域内表现出稳定的预测,与最小的异常值.
- 在所有特征重要性方法中,粒子大小始终被确定为影响MP毒性预测的最重要特征.
结论:
- 开发的QSAR模型提供了一种可靠的方法来预测MP的毒性.
- 颗粒大小是MP毒性的关键决定因素.
- 这些模型可以支持初步的环境暴露评估,并提高对MP相关健康风险的理解.
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