通过复合酶聚合酶放大-横向流量滴针测试来可视化检测烟草炭
Tao Li1, Ji Feng1, Yangyin Chen1
1Department of Plant Pathology, Zhejiang Agriculture and Forest University, Hangzhou 311300, China.
Plant disease
|August 15, 2024
概括
使用重组酶聚合酶放大侧流测量棒 (RPA-LFD) 的新诊断方法可以快速检测烟草中的关键人类病原体. 这种设备独立的测定有助于早期疾病管理,并减少经济损失.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子诊断学 分子诊断
- 农业科学 农业科学
背景情况:
- 由*Colletotrichum* spp.引起的炭病严重影响烟草作物,导致中国的经济损失很大.
- 准确和早期的疾病诊断对于有效管理烟草炭病至关重要.
- 现有的诊断方法可能缺乏现场应用所需的速度和可访问性.
研究的目的:
- 为了研究与烟草炭糖有关的*Colletotrichum*物种的多样性.
- 开发一种快速的,独立于设备的诊断方法,用于影响烟草的主要*Colletotrichum*物种.
- 评估开发的诊断试验的灵敏度和特异性.
主要方法:
- 在受感染的烟草叶子上研究了*Colletotrichum*物种多样性.
- 开发了一种重组聚合酶放大-侧流滴杆 (RPA-LFD) 试验,准丁合成酶1 (*chs1*) 基因.
- 为现场应用优化了一种快速DNA提取方法 (聚乙烯糖醇-KOH).
主要成果:
- 确定了 *C. karstii*, *C. fructicola* 和 *C. gloeosporioides* 作为主要的人类病原体.
- RPA-LFD测定在610分钟内检测到这些物种,检测极限为1pg的基因组DNA.
- 该试验显示高特异性,没有与其他真菌物种的交叉反应.
- 结合DNA提取和RPA-LFD允许在30分钟内在没有专门设备的情况下进行可视化.
结论:
- 开发的RPA-LFD测定是一种快速,灵敏和设备独立的工具,用于诊断烟草炭病.
- 这种方法显示了现场部署的巨大潜力,特别是在资源有限的环境中.
- 该试验促进了早期检测,使得及时的疾病管理和减轻烟草作物的经济损害.
