在子宫内膜异位症中识别与细胞死亡相关的编程基因和诊断生物标志物,使用机器学习和门德尔随机化方法
Zi-Wei Xie1,2, Yue He1,2, Yu-Xin Feng1,2
1Department of Gynecology, People's Hospital Affiliated of Fujian University of Traditional Chinese Medicine, Fuzhou, China.
Frontiers in endocrinology
|August 16, 2024
概括
这项研究确定了TNFSF12,AP3M1和PDK2作为子宫内膜异位症 (EM) 的关键生物标志物. 这些与编程细胞死亡 (PCD) 相关的基因为早期诊断和个性化治疗这种常见的妇科疾病提供了潜力.
科学领域:
- 妇科 妇科 妇科 妇科
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 遗传学 是一个
背景情况:
- 子宫内膜异位症 (EM) 是一种常见的妇科疾病,与不孕症和不规则的月经有关.
- 编程细胞死亡 (PCD) 在EM病原发生中起着至关重要的作用,但其精确的机制仍然不清楚,导致诊断延迟.
- 确定可靠的PCD生物标志物对于改善EM诊断和治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 确定与子宫内膜异位症 (EM) 中的编程细胞死亡 (PCD) 相关的新生物标志物.
- 开发一种使用已识别的PCD相关基因来诊断EM的诊断模型.
- 探索这些生物标志物的潜力,以指导EM的个性化治疗方法.
主要方法:
- 利用基因表达综合 (GEO) 数据集来识别EM中差异表达的基因 (DEG).
- 与PCD相关基因交叉引用DEG,以确定差异表达的PCD相关基因 (DPG).
- 应用孟德尔随机化,机器学习和分子对接来验证生物标记者候选者并评估药物相互作用.
主要成果:
- 确定了TNFSF12,AP3M1和PDK2作为EM的关键生物标志物.
- 建立了基于这三个基因的EM诊断模型,显示了差异性表达模式 (TNFSF12和PDK2上调;AP3M1下调).
- 通过单细胞分析证实了这些基因作为生物标记物的潜力,并证明了它们与现有的临床药物结合的亲和力.
结论:
- 系统地阐明了PCD在EM中的分子作用.
- 验证了TNFSF12,AP3M1和PDK2作为子宫内膜异位症的重要生物标志物.
- 这些发现为改善EM患者的早期诊断和量身定制的治疗干预措施铺平了道路.
