临床参数和疾病转录组网络的数据集与斑马鱼 (Danio rerio) 幼虫暴露于citalopram相关
Kira J Kazi1, Cole D English1, Emma Ivantsova1
1Center for Environmental and Human Toxicology, Department of Physiological Sciences, College of Veterinary Medicine, University of Florida, Gainesville, FL 32611, USA.
Data in brief
|August 19, 2024
概括
选择性血清素再吸收抑制剂 (SSRI),如citalopram影响水生生物. 暴露在西塔洛普拉姆的斑马鱼显示了与大脑和心脏功能障碍相关的基因表达改变,突出显示了环境风险.
科学领域:
- 环境毒理学环境毒理学
- 水生生态毒理学 水生生态毒理学
- 药物基因组学 药物基因组学
背景情况:
- 选择性血清素再吸收抑制剂 (SSRI) 经常在水生环境中检测到.
- 了解SSRI对水生生物的分子影响对于环境风险评估至关重要.
研究的目的:
- 为了研究利暴露对斑马鱼发育中的基因表达的影响.
- 在水生模型中识别受到citalopram影响的分子通路和疾病网络.
主要方法:
- 发育中的斑马鱼被暴露在0,10或1000μg/L的西塔洛普拉姆中,持续7天.
- 进行RNA测序来分析基因表达差异.
- 生物信息工具被用来构建分子网络并识别受影响的途径.
主要成果:
- 在斑马鱼中,Citalopram暴露显著改变了基因表达.
- 受影响的途径包括与交感神经活动,血压和血管度相关的途径.
- 确定了与大脑功能障碍 (例如,前列腺素-内氧化物合成酶2) 和心脏功能障碍相关的转录.
结论:
- 在斑马鱼发育过程中,Citalopram暴露会诱导显著的分子变化,影响神经和心血管系统.
- 该研究强调了SSRI在水生生态系统中的潜在风险.
- 分子网络分析提供了关于citalopram毒性的机制的见解.
