高通量蛋白质组学与轨道轨道天体的拐点:生物流体,细胞和组织的分析
Nathan G Hendricks1, Santosh D Bhosale1, Angel J Keoseyan1
1Precision Biomarker Laboratories, Cedars-Sinai Medical Center, Beverly Hills, California 90211, United States.
Journal of proteome research
|August 20, 2024
概括
本研究介绍了使用Orbitrap和Astral质量分析仪的高通量蛋白质组学工作流. 该方法增强了细胞和组织中的蛋白质识别,有助于生物标志物发现和疾病病理学研究.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 质谱测量质量谱测量
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 质谱技术的进步对于全面的蛋白质组分析至关重要.
- 有效和可重复的样本准备对于高通量蛋白质组学至关重要.
- 翻译性研究需要强大的工作流程来分析各种生物样本.
研究的目的:
- 介绍一个全面的蛋白质组学工作流程,集成Orbitrap和Astral质量分析仪.
- 为了证明适应性聚焦声学 (AFA) 和自动化SP3用于样本准备的有效性.
- 突出工作流在生物标志物发现和疾病病理学的实用性.
主要方法:
- 使用Orbitrap和Astral质量分析仪进行蛋白质组学分析.
- 集成适应聚焦声学 (AFA) 用于高通量细胞和组织溶解.
- 自动化洗剂兼容的单,固相增强样品制备 (SP3) 方法用于蛋白质消化.
主要成果:
- 通过数据独立获取,通过24分钟的梯度在细胞和组织 (心脏,肝脏,肺,肠道) 中识别了超过10,000种蛋白质.
- 证明了高可重复性,超过80%的蛋白质的变化系数 (CV) 在HeLa消化注射中低于20%.
- 45分钟的运行确定了大约90%的表达蛋白质组,展示了广泛的覆盖范围.
结论:
- 提出的蛋白质组学工作流是强大的,高吞吐量,并与不同的样本类型兼容.
- 这种综合方法显著提高了用于翻译研究的蛋白质识别能力.
- 该工作流具有很大的潜力,可以促进生物标志物发现和了解疾病病理学.


