通过批量和单细胞转录组分析,对非酒精性脂肪肝和动脉样硬化之间的共享风险基因和免疫代谢的全面分析
Qian Hu1,2, Yunfang Luo3,4, Hao He5
1Center for Medical Genetics, School of Life Sciences, Central South University, Changsha, Hunan, China.
Heliyon
|August 21, 2024
概括
这项研究确定了七个共同的基因,将非酒精性脂肪性肝病 (NAFLD) 和动脉样硬化 (AS) 联系起来,揭示了这两种疾病中的免疫和代谢失调. 这些发现为NAFLD和AS提供了潜在的治疗点.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 基因组学就是基因组学.
- 心血管科学 心血管科学
背景情况:
- 非酒精性脂肪肝 (NAFLD) 和动脉样硬化 (AS) 具有共同的临床联系.
- 了解它们的病原性相互关系对于开发有效的治疗方法至关重要.
研究的目的:
- 通过生物信息学分析揭示NAFLD和AS之间的病原性相互关系.
- 为了确定共同的风险基因,并了解这两种疾病的免疫和代谢格局.
主要方法:
- 利用美国国家健康和营养检查调查 (NHANES) 数据 (1999-2018) 进行关联分析.
- 在NAFLD和AS数据集 (GSE130970,GSE28829) 上进行了权重基因同表达网络分析 (WGCNA).
- 通过基因交叉和验证识别了差异表达基因 (DEG) 和常见风险基因 (ACP5,TP53I3,RPS6KA1,TYMS,TREM2,CA12,IFI27).
主要成果:
- NAFLD与动脉样硬化心血管疾病 (ASCVD) 风险显著相关 (OR=2.32).
- 七个常见的风险基因显示了NAFLD和AS的诊断能力.
- 免疫透分析显示,在这两种疾病中,免疫力失调.
- 单细胞测序突出了免疫细胞中的异常基因表达和代谢障碍 (脂肪酸代谢).
结论:
- 确定了七个共享的枢纽基因,具有NAFLD和AS的诊断潜力.
- 描绘了两种疾病所涉及的免疫和代谢景观.
- 结果为NAFLD和AS提供了全面的关联和潜在的治疗目标.
