自由空间 - 一组新的商业可用的分子,用于成功发现
Mykola V Protopopov1,2, Valentyna V Tararina2,3, Fanny Bonachera4
1Chemspace LLC, Kyiv, Ukraine.
Molecular informatics
|August 22, 2024
概括
药物发现现在使用大型化合物集的虚拟选. 一个新的"自由空间"数据集提供了高度可合成的分子,扩大了用于药物开发的化学探索.
科学领域:
- 药用化学 医学化学
- 计算化学计算化学
- 药物发现 药物发现 药物发现
背景情况:
- 高性能虚拟查可用于药物发现的庞大化合物库的探索.
- 虚拟选的实用性取决于候选分子的化学可行性和药物相似性.
- 在药物设计中,Enamine REAL Space是利用大规模,编号数据集的成功例证.
研究的目的:
- 介绍和描述自由空间,这是一个新的数据集,由按需制造的化合物组成.
- 与现有的数据集相比,评估自由空间的合成可行性和化学多样性.
- 突出自由空间在增强打击寻找和打击引领活动方面的潜力.
主要方法:
- 基于合成可行性原则的自由空间数据集的生成.
- 基架和化学分析以比较自由空间与Enamine REAL Space和ChEMBL数据库化合物.
- 对自由空间内的化合物的合成成功率的评估.
主要成果:
- 自由空间包括按需制造的化合物,预测合成成功率高 (>75%).
- 与REAL Space和ChEMBL相比,脚手架和化学分析揭示了自由空间的独特化学特征.
- 自由空间代表了合成可访问的化学多样性的显著扩张.
结论:
- 自由空间数据集为药物发现提供了宝贵的资源,因为它提供了对新型,合成可行的化学物质的访问.
- 它独特的化学空间补充了现有的数据集,使早期药物开发的更全面的探索成为可能.
- 利用自由空间可以提高击中寻找和领先优化流程的效率和成功率.
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