一系列指蛋白的成员指定了不同的霍克斯染色体边界
Havva Ortabozkoyun1, Pin-Yao Huang2, Edgar Gonzalez-Buendia1
1Howard Hughes Medical Institute, Miller School of Medicine, University of Miami, Miami, FL 33136, USA; Department of Human Genetics, Miller School of Medicine, University of Miami, Miami, FL 33136, USA; Sylvester Comprehensive Cancer Center, Miller School of Medicine, University of Miami, Miami, FL 33136, USA; Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, NYU Langone Health, New York, NY 10016, USA; Howard Hughes Medical Institute, NYU Langone Health, New York, NY 10016, USA.
新的指蛋白 (ZNFs) 在发育过程中在Hox集群中建立了明显的染色质边界. 这些新型绝缘体,与凝聚素作用,调节细胞命运和定位身份,独立于CCCTC-结合因子 (CTCF).
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 细胞类型特定的基因表达依赖于将染色质分成活性和抑制的部分.
- CCCTC-结合因子 (CTCF) 是一个关键的绝缘体,但其在分化过程中在Hox集群中的未变占用率表明其他因素调解了动态边界变化.
- 凝聚蛋白对染色质环形成至关重要,暗示其在建立发育性染色质边界中的作用.
研究的目的:
- 独立于已知的绝缘体 (CTCF,MAZ) 调查基于凝聚素的染色质占用率.
- 确定建立动态色素边界的新型因素,特别是在发育上重要的Hox集群中.
- 了解这些因素在调节发育过程中的位置特征和细胞命运中的作用.
主要方法:
- 检查了基于凝聚素的染色质占用率.
- 鉴定和表征了一种指蛋白 (ZNFs) 的家族,它们在染色质绝缘中具有潜在的作用.
- 评估了在霍克斯集群中鉴定的ZNFs的组织特异表达和功能贡献.
主要成果:
- 确定了一个ZNFs家族,其中一些具有组织特异性表达,有助于染色质边界.
- 发现了两个ZNFs,PATZ1和ZNF263,在Hox集群中建立了明显的染色质边界.
- 在运动神经元分化和小鼠骨发育中,PATZ1对胸脊边界至关重要.
- ZNF263有助于宫胸边界.
结论:
- 新型ZNFs与凝聚素一起作用,在Hox集群中建立了明显的染色质边界.
- 这些ZNF提供了与CTCF独立或组合运作的绝缘活动.
- 这些机制对于在发育过程中实施精确的位置认同和细胞命运至关重要.
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