高分辨率化曲线分析:在感染的树中检测Ceratocystis eucalypticola和C. manginecans的检测试验
Kira M T Lynn1, Michael J Wingfield1, Almuth Hammerbacher2
1Department of Biochemistry, Genetics and Microbiology, Forestry and Agricultural Biotechnology Institute (FABI), University of Pretoria, Private Bag X20, Pretoria, 0028, South Africa.
Fungal biology
|August 22, 2024
概括
一种新的高分辨率化曲线分析 (HRMA) 快速检测到树的病原体和病原体,Ceratocystis eucalypticola和C. manginecans. 这种方法可以快速识别受感染的植物材料,有助于对树种植园的疾病管理.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子诊断学 分子诊断
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
背景情况:
- 树种植园面临着巨大的癌症和枯疾病的威胁.
- 拉丁美洲Ceratocystis类 (LAC) 中的物种,特别是C. eucalypticola和C. manginecans,是这些毁灭性疾病的主要致病原体.
- 目前对这些病原体的诊断方法耗时,需要开发快速查协议.
研究的目的:
- 开发和验证一种高分辨率化曲线分析 (HRMA) 试验,用于快速检测和区分C. eucalypticola和C. manginecans.
- 绕过漫长的传统隔离和PCR后的病原体识别程序.
- 为了评估测试的准确性,直接从受感染的树样本中识别这些病原体.
主要方法:
- 设计的原料向了172bp区域的酸 (CP) 基因.
- 高分辨率化曲线分析 (HRMA) 的应用,用于病原体检测.
- 使用纯真菌DNA和直接从自然感染的树木样本中提取的DNA进行测试.
主要成果:
- 开发的HRMA试验准确地检测和量化了C. eucalypticola和C. manginecans的DNA,这些DNA来自两种培养和受感染的木材样本.
- HRMA成功地区分了C. eucalypticola和C. manginecans以及其他经过测试的LAC物种.
- 该测试可以在物种层面上识别七种LAC物种,包括C. fimbriata,C. polyconidia是唯一检测到的非LAC目标外物种.
结论:
- 开发的HRMA试验提供了一种快速而准确的方法,可以直接从受感染的树材料中识别C. eucalypticola和C. manginecans.
- 这种诊断工具有可能显著改善受Ceratocystis病原体影响的树种植园的疾病管理策略.
- 该测试能够选多种LAC物种,这为植物疾病诊断提供了更广泛的应用.
