将数字表型化原始数据转化为可操作的生物标志物,质量指标和数据可视化,使用皮层软件包:教程
James Burns1, Kelly Chen1, Matthew Flathers1
1Division of Digital Psychiatry, Beth Israel Deaconess Medical Center, Harvard Medical School, Boston, MA, United States.
Journal of medical Internet research
|August 23, 2024
概括
皮层是一个开源管道,简化了数字表型数据分析. 它帮助研究人员评估数据质量,推导出临床特征,并为可重现的研究创建可视化.
科学领域:
- 数字健康数字健康
- 计算精神病学是一种计算精神病学.
- 数据科学数据科学数据科学
背景情况:
- 数字表型,使用来自消费者设备的数据,对于研究来说越来越重要.
- 处理这些数据并得出可复制的特征是一个重大挑战.
- 现有的工具缺乏全面的数据质量,特征提取和可视化解决方案.
研究的目的:
- 介绍Cortex,一个开源数据处理管道用于数字表型.
- 为使用Cortex进行数据分析,质量评估和可视化提供实用指南.
- 通过一个用户友好的工具展示数字表型研究的可访问性和严格性.
主要方法:
- 开发了Cortex,这是一个为mindLAMP平台优化的开源Python软件包.
- 插图数据处理,质量评估,特征导出和可视化技术.
- 包括创建相关性矩阵和现实世界的临床应用程序的示例代码.
主要成果:
- 皮层可以实时评估数据质量.
- 该管道有助于从数字表型化数据中推导可复制的临床特征.
- 皮层支持创建易于共享的数据可视化.
结论:
- 皮层增强了数字表型研究的可访问性和方法严格性.
- 该工具使研究团队能够有效地分析各种数字表型化数据集.
- 皮层促进可复制的研究实践在不断增长的数字健康领域.


