在非定向质谱学中用于化合物注释的机器学习方法-关于指纹,片和新方法的简要概述
Francesco F Russo1, Yannek Nowatzky2, Carsten Jaeger3
1Department of Analytical Chemistry and Reference Materials, Organic Trace Analysis and Food Analysis, Bundesanstalt für Materialforschung und -prüfung (BAM), Berlin, Germany.
机器学习 (ML) 工具有助于在使用质谱 (MS) 的非定向查 (NTS) 中识别化合物. 本综述比较了NTS数据分析的ML方法,指导研究人员和开发人员.
科学领域:
- 分析化学 分析化学
- 计算化学的计算化学
背景情况:
- 非定向查 (NTS) 在法医,健康和环境科学中至关重要.
- 由于高吞吐量和灵敏度,质谱 (MS) 是NTS的首选方法.
- 在MS数据中复合物识别 (注释) 是劳动密集型的,推动了对计算工具的需求.
研究的目的:
- 审查和比较NTS中复合注释的机器学习 (ML) 方法.
- 为研究人员提供MS数据分析可用的ML工具的全面概述.
- 在基于MS的NTS中确定ML的当前差距和未来方向.
主要方法:
- 对NTS基于ML的复合注释工具的系统文献综述.
- 对不同ML模型进行比较分析,重点关注功能和性能指标.
- 在MS数据分析中用于ML模型培训和验证的数据集的探索.
主要成果:
- 在NTS中对化合物进行注释的可用ML方法目录.
- 对ML模型性能和独特特征进行细微比较.
- 识别当前方法和数据集的局限性.
结论:
- 机器学习工具显著提高了NTS中复合注释的效率.
- 清楚地了解ML方法的特征和性能对于有效应用至关重要.
- 需要进一步开发来解决现有的差距,并改进基于ML的NTS分析.
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