与二硫化相关的长非编码RNA特征用于预测低度质瘤分类,预后,瘤微环境和治疗方案:观察性研究

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 低度质瘤 (LGG) 是异质的脑瘤.
• 溶硫脱是一种新兴的细胞死亡途径,在癌症中具有潜在的作用.
• 长非编码RNAs (lncRNAs) 越来越多地被认为是各种癌症的关键调节者,包括LGG.

研究的目的:

• 调查与二硫化相关的长非编码RNAs (DAlncRNAs) 在LGG中的作用.
• 开发基于DAlncRNAs的LGG预后特征.
• 预测LGG分类,预后,瘤微环境以及对免疫治疗和化疗的反应.

主要方法:

• 来自癌症基因组图谱 (TCGA) 的526名LGG患者的基因组,临床和突变数据的生物信息学分析.
• 患者分类的非负矩阵因子化.
• 单变体,LASSO和多变体的考克斯回归用于预后的DAlncRNA识别.
• 开发一个预后签名和名ogram.

主要成果:

• 确定了两种LGG亚型 (C1和C2),与二硫化相关.
• 鉴定出了8种预后性DAlncRNAs,形成了一个新的预后特征.
• DAlncRNA签名独立预测LGG预后,并与瘤微环境特征相关.
• 高风险患者表现出更活跃的免疫功能,更高的瘤突变负担和更差的预后,主要属于C2亚型.
• 签名预测了免疫疗法 (高风险) 和化疗 (低风险) 的不同反应.

结论:

• DAlncRNAs在LGG病原和预后中发挥着重要作用.
• 一个基于DAlncRNA的新预后签名可以有效地分类LGG亚型并预测患者的结果.
• 这种签名有可能指导个性化治疗策略,包括在LGG中选择免疫治疗和化疗.