确定与哺乳期荷尔斯坦奶牛胚胎死亡率和生育特征相关的候选SNP
Carolina L Gonzalez Berrios1, Courtney F Bowden2, Hamad M Saad3
1Animal Reproduction and Biotechnology Laboratory, Department of Biomedical Sciences, Colorado State University, Fort Collins, CO, United States.
Frontiers in genetics
|August 26, 2024
概括
研究人员确定了与霍尔斯坦牛生育相关的单核酸多态 (SNP). DSC2,SREBF1,UBD,DECR1,FASN和BOLA-DMB基因中的特定SNP与第一个分娩年龄和受孕率等特征有关.
科学领域:
- 动物遗传学和动物基因组学
- 牲畜中的生殖生物学
- 乳制品科学与生产 乳制品科学与生产
背景情况:
- 使用向单核酸多态 (SNP) 的基因组预测旨在提高霍尔斯坦牛的遗传传递能力.
- 生育特征对于乳制品生产效率至关重要,早期胚胎死亡率是一个重大问题.
研究的目的:
- 确定和验证与生育特征相关的SNP,特别关注那些影响霍尔斯坦牛早期胚胎死亡率的SNP.
- 探索已识别的SNP在开发基因选择工具以提高乳牛生育能力方面的潜力.
主要方法:
- 从正常和胚胎死亡概念的mRNA测序数据被用于检测SNP.
- 候选SNP的选择是基于与生殖特征的关联,并在500头霍尔斯坦牛的单独队列中进行验证.
- 用PLINK软件进行了基因型-表型分析,用于质量控制和统计评估的通用线性模型.
主要成果:
- 在23个质量控制的SNP中,有7个显示出与生育特征的显著关联 (p < 0.05).
- 特定的SNP与第一次分娩时的年龄 (DSC2),怀孕时间 (SREBF1,UBD),第一次人工授精时的怀孕 (DECR1,FASN) 和在牛奶中怀孕150天 (SREBF1,BOLA-DMB) 相关.
- DSC2 SNPs中的G基因组与第一次分娩时的年龄减少10天有关,这表明具有显著的基因组替代效应.
结论:
- 鉴定到的SNP,特别是在DSC2基因中,是改善霍尔斯坦牛生育能力的有希望的遗传标记物.
- 这些候选SNP可以为乳制品生产系统的先进遗传选择工具的开发做出贡献.
- 进一步的研究可以利用这些发现来提高生殖效率并减少与不孕症相关的经济损失.
