对Xpert Carba-R试验的评估,用于量化便样本中产生碳酶的细菌负载
Jie Yin Chua1,2, Ze Qin Lim1,2, Song Qi Dennis Loy1,2
1National Centre for Infectious Diseases, Singapore, Singapore.
PloS one
|August 28, 2024
概括
Xpert Carba-R Ct值可以估计便样本中的碳酶生成生物体 (CPO) 细菌负载,为跟踪CPO运输提供了比传统方法更快的替代方案.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断
背景情况:
- 碳胺酶产生的生物 (CPO) 构成了全球健康的重大威胁.
- 目前用于量化CPO基因负载的方法涉及培养和PCR测定,缺乏持续携带风险评估的速度和准确性.
研究的目的:
- 评估Xpert Carba-R Ct值的准确性,以估计便样本中产生碳酶的细菌负载.
主要方法:
- 便样本中添加了特定的碳酶基因 (blaKPC,blaNDM,blaVIM,blaOXA-48,blaIMP-1) 并连续稀释.
- 样品经过Xpert Carba-R测定和传统培养,以生成与细菌计数相关联的Ct值的标准曲线.
- 标准曲线使用患者便样本进行验证.
主要成果:
- 对blaNDM,blaKPC和blaOXA-48的检测极限约为103cfu/mL;对于blaIMP-1和blaVIM,它约为104cfu/mL.
- 验证显示,对估计细菌负载的估计具有合理的准确性,blaNDM和blaOXA-48.8的平均角值.
结论:
- 在Xpert Carba-R Ct值提供了可靠的估计,在便样本中产生碳酶的细菌负载.
- 这种方法为评估CPO运输和传播风险提供了潜在的更快,更准确的方法.
