通过SYBR绿色基实时PCR和循环介导同热放大 (LAMP) 来检测Cryphonectria Hypovirus 1 (CHV1) 的新检测方法
Ali Çelik1, Deniz Çakar2, Sibel Derviş3,4
1Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, Bolu Abant İzzet Baysal University, Bolu 14030, Türkiye.
Viruses
|August 29, 2024
概括
对于cryphonectria hypovirus 1 (CHV1) 的新诊断方法,为检测这种生物控制剂提供了更高的灵敏度. 这些测试改善了对Cryphonectria parasitica中的CHV1的监测,有助于生物控制策略.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 病毒学 病毒学
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 菌类病毒可以作为生物控制剂,减少植物病原菌的影响,增强植物健康.
- 克里福尼克特里亚低病毒1 (CHV1) 显著降低了 *Cryphonectria parasitica* 的毒性,这是栗子病原体.
研究的目的:
- 引入两种新的诊断协议,以准确有效地检测CHV1.
- 与现有方法相比,评估这些新测试的灵敏度和性能.
主要方法:
- 开发一种以色度循环介导的同热放大 (LAMP) 试验,针对CHV1 ORF A. A.
- 开发一种实时定量PCR (qPCR) 试验,针对CHV1 ORF B.
- 对LAMP和qPCR与反转录PCR (RT-PCR) 和巴文达姆测试进行比较分析.
主要成果:
- 与RT-PCR相比,LAMP测试显示灵敏度增加了十倍,在35分钟内可见的颜色变化.
- 在qPCR测试显示了显著的100倍提高灵敏度比RT-PCR.
- 在区分低病毒性菌株方面,LAMP和qPCR都超过了Bavendamm测试.
结论:
- 已经开发了两种先进的,高度敏感的CHV1检测诊断试验.
- 这些先进的方法代表了CHV1监测的显著改进.
- 这些试验对促进对C. parasitica*生物控制的研究有很大的前景.
