在九个生物地理群体中药物遗传变异的模式
Sophia Hernandez1, Lucia A Hindorff1, Joannella Morales1
1National Human Genome Research Institute, National Institutes of Health, Bethesda, Maryland, USA.
药物遗传 (PGx) 变体的频率在全球人口中显著不同. 大多数PGx数据低估了某些群体的代表性,这可能会扩大精准医学中的健康差异.
科学领域:
- 药物基因组学 药物基因组学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 药物新陈代谢 药物新陈代谢
背景情况:
- 药物遗传 (PGx) 变异频率在全球人口中存在很大差异.
- 现有的PGx文献往往侧重于有限的人口群体或特定的基因,使用非标准化的定义.
- 这可能导致PGx引导药物选择的应用不公平.
研究的目的:
- 通过使用临床药物遗传实施联盟 (CPIC) 准则的精选数据,在九个生物地理群体中比较变异功能等位基因的种群群体大小和等位基因频率.
- 在不同种群中识别具有变异功能等位基因频率差异显著的基因.
主要方法:
- 从23个CPIC指南中提取了对19个药物遗传基因的等位基因频率数据.
- 在九个定义的生物地理群体中分析和比较等位基频率.
- 在代表性不足的群体中存在但不在最大的参考组中存在的鉴定过的等位基因.
主要成果:
- 在研究的19个基因中,16个基因的策划文献中,欧洲人口群体是最多的.
- 美国和大洋洲群体的代表性最低.
- 在非参考组中检测到近200个等位基因,这些等位基因在最大的参考组中不存在.
- 在非参考组中,CYP2B6和CYP2C9显示出更高频率的功能改变等位基因,而CYP4F2,DPYD,SLCO1B1和UGT1A1显示出更低的频率.
结论:
- 药物遗传性等位基频率和功能在九个生物地理群体中表现出相当大的差异.
- 大多数生物地理群体在可用的PGx数据中代表性不足.
- 需要加大努力来描述全球PGx变异,以防止加剧健康差异,并确保公平地实施PGx导向疗法.
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