识别特定的APOE转录和与阿尔茨海默病相关的功能元素

科学领域:

• 神经遗传学 神经遗传学
• 基因组学就是基因组学.
• 阿尔茨海默氏症疾病研究研究

背景情况:

• 无脂蛋白E (APOE) 基因是晚发性阿尔茨海默病 (LOAD) 的主要遗传风险因素.
• 在APOE位点的基因调节机制尚未完全理解,这阻碍了治疗的发展.

研究的目的:

• 识别与阿尔茨海默病 (AD) 相关的APOE位点内的新功能元素.
• 阐明人类大脑中APOE基因表达背后的调节机制.

主要方法:

• 综合单核酸多态 (SNP) 数据与多omics数据集 (RNA-seq,DNA甲基化,ChIP-seq) 来自各种祖先的人类死后大脑.
• 在人类大脑发育过程中分析了APOE转录表达轨迹.

主要成果:

• 鉴定了一种新的与AD相关的APOE转录 (jxn1.2.2) 主要存在于背侧前额叶皮层 (DLPFC).
• 相关的APOE jxn1.2.2具有神经病理特征,认知衰退和APOE4等位基因.
• 优先考虑两个功能性SNP (rs157580,rs439401) 影响jxn1.2.2丰度和DNA甲基化,位于影响转录因子结合的活性染色体区域.

结论:

• 发现了新的APOE功能元素,为阿尔茨海默病提供了潜在的治疗点.
• 通过对APOE基因调节的表征,提供了对AD病因学的机制性见解.