种植的小麦物种的高度动态的卫星体
Ana Gálvez-Galván1, Manuel A Garrido-Ramos2, Pilar Prieto1
1Plant Breeding Department, Institute for Sustainable Agriculture, Agencia Estatal Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), Avda. Menéndez Pidal, Campus Alameda del Obispo s/n, 14004 Córdoba, Spain.
Annals of botany
|August 30, 2024
概括
杜鲁姆和面包小麦卫星DNA在不到8000年的时间里迅速演变,显示了重复数,位置和序列分歧的显著变化,突出了这些种植作物的加速进化.
科学领域:
- 植物基因组学 植物基因组学
- 分子进化是分子进化的过程.
- 重复的DNA研究是重复的DNA研究.
背景情况:
- 硬小麦 (Triticum turgidum) 和面包小麦 (Triticum aestivum) 是最近进化的全多类物种.
- 这两种物种在种植过程中都经历了广泛的人工选择.
- 了解它们的卫星体,可以了解基因组的快速演变.
研究的目的:
- 为了表征硬小麦的卫星体.
- 为了与面包小麦卫星进行比较分析.
- 为了研究小麦中卫星DNA的进化动态.
主要方法:
- 利用satMiner协议在 durum小麦中发现卫星DNA.
- 雇佣了RepeatExplorer2用于阅读集群和RepeatMasker用于丰富度估计.
- 进行光在位杂交 (FISH) 进行染色体定位和比较基因组分析.
主要成果:
- 在两个小麦物种的卫星DNA集中发现了显著的定性和定量变化.
- 观察到重复和卫星位置的特定物种扩张/收缩.
- 在过去的8000年内,记录了高速的序列变化和卫星DNA家族的出现/丧失.
结论:
- 硬麦和面包小麦的卫星DNA已经以加速的速度发展.
- 这些变化与中心体和亚端体区域的可转移元素和多态性有关.
- 这些发现为小麦的进化起源和人类驱动的选择压力提供了背景.


