2500种食物的微生物多样性和与人类微生物组的联系
Niccolò Carlino1, Aitor Blanco-Míguez1, Michal Punčochář1
1Department of Cellular, Computational and Integrative Biology, University of Trento, Trento, Italy.
Cell
|August 30, 2024
概括
经过策划的食品基因组数据 (cFMD) 资源显示了食品中的广泛微生物多样性. 这些食物微生物有助于人类的肠道微生物群,其中一些可能从食物转移到肠道.
科学领域:
- 微生物学
- 基因组学
- 食品科学
背景情况:
- 食物含有复杂的微生物组,
- 这些食物微生物组的多样性和影响尚未完全理解.
研究的目的:
- 创建一个全面的食物元基因组数据资源.
- 探索食物中的微生物物种多样性.
- 研究食物微生物对人类肠道微生物的贡献.
主要方法:
- 整合了1950个新测序的基因组和583个公共食品基因组.
- 从食品样本生成了10899个元基因组组合基因组 (MAG).
- 对20,000个人类基因组进行了MAG分析.
主要成果:
- 这份精心策划的食品基因组数据 (cFMD) 资源包含10899个可销售基因组,其中包括320个新 taxa.
- 在食品类别内和食品类别之间观察到显著的微生物多样性.
- 食物微生物约占成年人肠道微生物群的3%.
- 确定了特定微生物物种的潜在食物到肠道传播和殖民.
结论:
- 这项cFMD资源显著扩大了对食品微生物组的了解.
- 食物微生物组在塑造人类肠道微生物组方面发挥着重要作用.
- 基因组学可以应用于食品质量,安全性和真实性.
