探索地下水中的水源病毒:通过被动采样和有针对性的丰富测序进行量化和病毒组表征
Cristina Mejías-Molina1, Ignasi Estarlich-Landajo2, Sandra Martínez-Puchol3
1Laboratory of Viruses Contaminants of Water and Food, Secció de Microbiologia, Departament de Genètica, Microbiologia i Estadística, Facultat de Biologia, Universitat de Barcelona (UB), 08028 Barcelona, Spain; Institut de Recerca de l'Aigua (IdRA), Universitat de Barcelona (UB), 08001 Barcelona, Spain.
城市地下水经常被人类病毒污染,对饮用水构成风险. 病毒被动采样和测序在近一半的检测样本中检测到人类腺病毒和其他病原体.
科学领域:
- 环境科学 环境科学
- 微生物学 微生物学
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 水层是全球人口很大一部分的重要饮用水来源.
- 微生物污染,特别是来自水中传播的病毒,如腺病毒,诺病毒和肠病毒,对地下水质量构成重大威胁.
- UPWATER项目解决了确定城市地下水污染源的挑战.
研究的目的:
- 调查城市地下水污染的来源.
- 评估地下水中八种病毒病原体的流行程度.
- 描述贝索斯河三角洲含水层的地下水病毒组多样性.
主要方法:
- 在7个月内利用病毒被动采样 (VPS) 来收集114个地下水样本.
- 使用尼龙和酸纤维素膜在10天的时间间隔内吸附病毒.
- 应用目标丰富测序 (TES) 来分析病毒的丰度和多样性.
主要成果:
- 在近50%的地下水样本中检测到人类便污染.
- 量化的人类腺病毒 (HAdV) 的平均总数从1.23E+02到3.66E+03 GC.
- 识别了偶尔的肠道病毒 (EV) 和诺病毒 (NoV GI和GII) 检测,以及包括腺病毒,天体病毒和轮状病毒在内的多样化的含水层病毒组.
结论:
- 使用VPS的时间集成采样提高了病毒检测概率.
- 将VPS与TES结合起来,可以全面了解地下水中的病毒流行情况.
- 这种方法可以支持高效的地下水库管理,特别是在资源有限的社区.
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