双RNA测序以阐明和Colletotrichum sublineola之间的相互作用
Saddie Vela1, Emily S A Wolf1, Jeffrey A Rollins1,2
1Plant Molecular & Cellular Biology Graduate Program, University of Florida, Gainesville, FL, United States.
Frontiers in fungal biology
|September 2, 2024
概括
研究人员研究了由Collettotrichum sublineola引起的炭糖,以了解宿主-病原体相互作用. 他们确定了与毒性有关的关键真菌基因,帮助开发了抗病种类.
科学领域:
- 植物病理学 植物病理学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 由Colletotrichum sublineola引起的炭病严重限制了在温暖,潮湿的地区的 (Sorghum bicolor) 产量,导致高达50%的损失.
- 尽管有基因组资源,但基础上的分子机制-C. sublineola 相互作用仍然不太了解.
研究的目的:
- 使用双RNA测序方法阐明和C. sublineola之间的分子交叉声.
- 为了识别C. sublineola的关键毒性因子,在感染耐药的加入时.
主要方法:
- 双RNA测序是在感染后1,3和5天 (dpi) 感染C. sublineola的四个耐药葡萄糖接口上进行的.
- 转录组分析的重点是C. sublineola的基因表达概况 in vitro与 in planta.
- 生物信息学预测效应因子候选物定位和功能.
主要成果:
- 在C. sublineola中,编码分泌效应因子,碳水化合物活性酶 (CAZymes) 和膜载体的基因在生物向死转变 (3 dpi) 期间表达的增加.
- 预计许多C. sublineola效应因子候选物将定位在宿主细胞囊中,可能会干扰的PAMP触发免疫 (PTI) 和ROS信号传递.
- 确定影响病原体致病性的关键分子因素.
结论:
- 这项研究为C. sublineola的分子生物学及其与的相互作用提供了宝贵的见解.
- 已识别的毒性因子可以作为开发具有遗传耐药性的果品种的资源.
- 了解这些相互作用对于提高生产率和粮食安全至关重要.
