检测和分子表征一种与Passiflora edulis Sims相关的新型线粒病毒
Yam Sousa Santos1,2,3, Andreza Henrique Vidal2,4, Emanuel Felipe Medeiros Abreu2
1Centro de Educação e Saúde, Universidade Federal de Campina Grande, Cuité, PB, 58175-000, Brazil.
Archives of virology
|September 2, 2024
概括
一种新型的米托病毒,类似于激情果的米托病毒1 (PfMv1),在激情果植物中被发现. 这一发现代表了Passiflora edulis中复制的米托病毒的第一个证据,提出了一个新物种Duamitovirus passiflorae.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 植物病理学 植物病理学
背景情况:
- 线粒体病毒是Mitoviridae家族中的神秘,无体病毒,存在于真菌线粒体中.
- 植物病毒可以显著影响经济重要作物,如激情果 (Passiflora spp. ) 的情况.
- 最近的进展使得从植物转录组数据中组装完整的线粒病毒样序列成为可能.
研究的目的:
- 为了识别和描述与巴西的激情果植物相关的新型线粒病毒.
- 为了确定已识别的病毒与已知的线粒病毒的遗传关系.
- 确认在宿主体内发现的病毒序列的复制性.
主要方法:
- 感染Passiflora spp. 的病毒的大规模基因组测序.
- 病毒结合物的新组装和序列分析,包括ORF识别和RdRP模式比较.
- 用RdRP.的氨基酸序列进行了植物遗传学分析.
- 反转录聚合酶链反应 (RT-PCR) 检测病毒RNA并排除DNA集成.
主要成果:
- 一个新的类似于mitovirus的序列,被指定为激情水果mitovirus-like 1 (PfMv1),从激情水果中确定.
- PfMv1拥有一个单一的开放式读取框架 (ORF),编码一种依赖于RNA的RNA聚合酶 (RdRP),具有保存的线粒病毒基因.
- 遗传学分析将PfMv1置于Duamitovirus属内,显示79%的覆盖率和50.14%的同样性与Humulus lupulus mitovirus 1.
- 通过RT-PCR检测证实了PfMv1RNA的存在,而没有DNA,这表明病毒正在复制.
结论:
- 这项研究首次证实了Passiflora edulis.中复制的米托病毒.
- 确定的病毒,PfMv1,代表了Duamitovirus属内的新物种.
- 这种新物种的拟议名称是Duamitovirus passiflorae.
