pQEB1:一个带有KPC-2的医院爆发等离子体血统

科学领域:

• 医学微生物学 医学微生物学
• 基因组流行病学 基因组流行病学
• 抗微生物耐药性 抗微生物耐药性

背景情况:

• 碳酶生成的肠杆菌 (CPE) 是一个主要的全球健康问题,因为它们对最后的抗生素有耐药性.
• 基因组监测对于了解抗生素耐药性基因和移动遗传元素的出现和传播至关重要.
• 在Enterobacteriaceae中识别的pQEB1等离子体系,携带卡巴酶基因blaKPC-2并赋予多药耐药性.

研究的目的:

• 在伊丽莎白女王医院对CPE的基因组监测期间确定的N型等离子体系pQEB1.
• 研究pQEB1等离子体谱系的遗传多样性,宿主范围和传播动态.
• 定义pQEB1等离子体结构变化背后的分子事件.

主要方法:

• 从患者样本中对产生卡巴酶的肠道细菌 (CPE) 进行基因组监测.
• 使用牛津纳米孔R10.4.1技术进行长读全基因组测序.
• 对完整的等离子体序列进行比较分析,以确定结构变异和分子事件.

主要成果:

• 在13个月的时间里,从11名患者的Citrobacter freundii,Enterobacter cloacae和Klebsiella物种的多个序列类型中确定了pQEB1等离子体系.
• 描述了pQEB1的结构变异,包括IS26介导的反转和插入序列/转位子的获取.
• 一种特定的pQEB1逆转变体与QE肝脏特异性相关,并有宿主间和患者间传播的证据.

结论:

• 在pQEB1等离子体系中,pQEB1等离子体系代表了一个具有广泛宿主范围和在医院环境中具有传染性的多药耐药元素.
• 通过结构变异,pQEB1的持续演变可能会提高其适应性和获得进一步抗性基因的潜力.
• 这些发现强调了持续基因组监测对于检测和控制新出现的抗生素耐药性威胁的传播的重要性.