在尼罗河三角洲,埃及的Mycobacterium结核病分离物中的耐药性和基因组变异

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 结核病 (TB) 仍然是一个重大的全球卫生挑战.
• 以前的研究表明,埃及的耐药结核病正在增加.
• 了解抵抗模式对于有效控制至关重要.

研究的目的:

• 为了研究埃及Mycobacterium结核病分离物的抗生素敏感性概况.
• 使用全基因组测序 (WGS) 识别与耐药性相关的遗传突变.
• 为尼罗河三角洲地区的结核病控制战略提供信息.

主要方法:

• 分析了来自开罗和亚历山大的102个结核菌菌分离物.
• 使用Löwenstein-Jensen介质,BD BACTEC MGIT 960 SIRE套件和扩散盘测试进行抗生素敏感性测试.
• 在Illumina平台上进行全基因组测序 (WGS),以识别遗传突变.

主要成果:

• 第4系菌株占主 (>80%),第3系菌株占11%.
• 药物耐药性率:链杆菌素 (31.0%),异化 (17.2%),利芬素 (19.5%) 和乙ambutol (20.7%).
• 47.1%的分离物对所有四种药物都敏感;一个分离物对所有四种药物都耐药. WGS揭示了新的和已知的突变.

结论:

• 在埃及结核病分离体中观察到高水平的耐药性和新突变.
• 结核病控制工作必须解决单抗和双抗菌株的流行问题.
• 尼罗河三角洲需要有针对性的干预措施,以制耐药结核病的传播.