大规模神经网络刺激的灵活建模:对外细胞潜力的虚拟电极记录工具 (VERTEX) 的电气和光学扩展
Anne F Pierce1,2, Larry Shupe3, Eberhard Fetz2,3
1Department of Bioengineering, University of Washington, Seattle, WA 98195, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|September 4, 2024
概括
我们改进了Virtual Electrode Recording Tool for EXtracellular Potentials (VERTEX) 软件,以支持各种神经刺激技术,包括光遗传学和复杂的协议,以实现更高效的体内研究.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 计算生物学 计算生物学
- 生物医学工程 生物医学工程
背景情况:
- 计算模型通过降低成本和道德问题来帮助体内神经刺激研究.
- 现有的模型缺乏对各种神经刺激技术,电极,模式和范式的支持.
研究的目的:
- 开发一个全面的软件扩展用于神经刺激建模.
- 以新的功能来增强外细胞潜力的虚拟电极记录工具 (VERTEX).
主要方法:
- 扩展了基于MATLAB的工具VERTEX,用于模拟多间隔神经元中的电场刺激.
- 集成支持多个电极对,双相/双极刺激和可编程延迟.
- 通过将辐射转换为电流,增加了光遗传刺激的建模.
- 实施复杂的刺激协议:配对脉冲,时空模式和闭环刺激.
主要成果:
- 使用VERTEX的内置功能展示了新的功能.
- 对现有模型和实验数据进行验证的结果.
结论:
- 扩展的VERTEX提供了一个统一的平台,用于测试各种神经刺激模式.
- 促进有效,系统,有针对性和个性化的刺激协议开发.


