在El Pedregal,阿雷基帕,秘鲁的狗介导狂犬病爆发的基因组特征

科学领域:

• 基因组学就是基因组学.
• 流行病学 流行病学
• 兽医医学 兽医医学 兽医医学

背景情况:

• 狂犬病是一种重新出现的动物性传染病,具有很高的死亡率.
• 秘鲁已经在普诺和阿雷基帕经历了狂犬病爆发.
• 埃尔佩德雷加尔在2021年经历了一次狂犬病爆发,随后的病例发生在2022年.

研究的目的:

• 通过基因组分析调查El Pedregal狂犬病疫情的起源.
• 了解秘鲁狂犬病病毒的遗传多样性和引入动态.
• 为该地区的狂犬病控制战略提供信息.

主要方法:

• 来自秘鲁的34个狗狂犬病病毒 (RABV) 基因组的测序 (2010-2023年).
• 使用纳米孔和Illumina测序技术.
• 遗传学分析以确定病毒关系和起源.

主要成果:

• 在El Pedregal中确定了两个不同的遗传集群,表明了多次引入.
• 2021年的疫情起源于单一的引入,而2022年的病例表明来自阿雷基帕的新引入.
• 所有新的序列形成了一个新的小分类 (Cosmopolitan Am5),其亲属在玻利维亚,阿根廷和巴西.

结论:

• 埃尔佩德雷加尔疫情是由于多次狂犬病病毒引入而引起的,这种引入是由人为媒介的运动促进的.
• 埃尔佩德雷加尔仍然面临着由狗传播的狂犬病的风险,原因是邻近地区的持续循环.
• 人类对狗的移动对区域狂犬病控制工作构成重大威胁.