茶叶在机械伤害压力下在乌龙茶收获后加工过程中发生的全基因组表观遗传动力学
Yucheng Zheng1, Xiaoxi Ou2, Qiuming Li2
1College of Tea and Food Sciences, Wuyi University, Tea Engineering Research Center of Fujian Higher Education, Tea Science Research Institute of Wuyi University, Wuyishan 354300, China; Key Laboratory of Tea Science, College of Horticulture, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350007, China.
Food research international (Ottawa, Ont.)
|September 4, 2024
概括
乌龙茶收获后加工过程中的机械伤害应力改变了DNA甲基化和染色质可访问性. 这种表观遗传重编程影响茶叶的质量,揭示了参与基因调节的CsMYC2等关键转录因子.
科学领域:
- 植物表观遗传学 植物表观遗传学
- 收获后技术 收获后技术
- 茶叶质量研究研究
背景情况:
- 乌龙茶的质量受到收获后加工的影响,包括机械伤.
- 表观遗传修饰,如DNA甲基化和染色质可访问性,在植物对压力的反应中起作用.
- 了解这些表观遗传变化可以提供关于茶叶基因组重编程和质量形成的见解.
研究的目的:
- 研究乌龙茶叶在收获后加工过程中对机械伤害的表观遗传反应 (5mC DNA 甲基化和染色质可访问性).
- 识别在受伤压力下涉及茶叶表观遗传重编程的转录因子 (TF) 和基因调控网络.
- 阐明CsMYC2的特定作用和表观遗传机制在调节醇生物合成中的相互作用.
主要方法:
- 在受伤茶叶中5mCDNA甲基化和染色质可访问性景观的表征.
- 对不同甲基化区域和可访问的促进体进行分析,以确定过度代表的TF结合动机.
- 构建染色体可访问性介导和CsMYC2-中心的基因调控网络.
- 以TF为中心的酵母单杂交试验验证TF结合点.
主要成果:
- 机械伤害导致了乌龙茶叶中DNA甲基化和染色质可访问性模式的显著变化.
- 几个TF约束性动机被过度代表,这表明关键的TF参与了质量监管.
- 确定了一个以CsMYC2为中心的基因调节网络,突出了它在收获后加工中的潜在作用.
- 在印生物合成基因 (CsTSB) 的促进者中观察到可访问的染色质和低甲基化的共存,这表明了联合调节.
结论:
- 通过DNA甲基化和染色质可访问性进行表观遗传重编程,对于在收获后加工过程中形成乌龙茶质量至关重要.
- CsMYC2是对机械伤害应激反应的关键调节器.
- 表观遗传机制共同调节醇生物合成,影响茶的味道和香气.
相关概念视频
00:53Transgenic Organisms
Overview
01:59Plant Breeding and Biotechnology
Crop cultivation has a long history in human civilization, with records showing the cultivation of cereal plants beginning at around 8000 BC. This early plant breeding was developed primarily to provide a steady supply of food.
01:11Pharmacogenetics of Drug Targets: β₂-Adrenergic Receptors, Apo E, Thymidylate Synthase
Genetic polymorphisms in drug targets have emerged as critical determinants of interindividual variability in drug response and toxicity. Pharmacogenomic investigations increasingly focus on identifying these variations to personalize and optimize therapeutic interventions. A drug target may be a receptor, enzyme, or signaling protein involved in pharmacologic responses or disease-related pathways. While early pharmacogenetic studies focused primarily on drug metabolism, current research...