应用MinION长读序列器用于半向检测食品传播病原体
Alexandre Lamas1, Ana Costa-Ribeiro2,3, Alejandro Garrido-Maestu4
1Food Hygiene, Inspection and Control Laboratory, Department of Analytical Chemistry, Nutrition and Bromatology, Campus Terra, University of Santiago de Compostela, Santiago de Compostela, Spain.
Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
|September 5, 2024
概括
下一代测序 (NGS) 提供了一种全面的解决方案,可以同时检测多种食源性病原体. 这种非有针对性的方法通过识别所有潜在威胁来提高食品安全,与传统的有针对性的方法不同.
科学领域:
- 食品微生物学 食品微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 公共卫生 公共卫生
背景情况:
- 食物传播的病原体对全球健康构成重大风险.
- 传统的基于文化的方法是耗时和劳动密集的.
- 基于DNA的向方法,如实时PCR (qPCR) 检测特定的病原体,但有可能错过其他病原体.
研究的目的:
- 提出一项用于同时检测关键的食源病原体的协议.
- 为了使检测到的细菌菌株的初步血清定型.
- 克服食品安全中针对性病原体检测的局限性.
主要方法:
- 利用下一代测序 (NGS),一种非目标分子技术.
- 开发了一种用于同时分析多种病原体的协议.
- 它的重点是检测沙门氏菌 Enteritidis,沙门氏菌 Typhimurium,Listeria monocytogenes 和大肠杆菌 Escherichia coli O157:H7.7.
主要成果:
- 证明了NGS在同时检测病原体方面的能力.
- 启用了特定的沙门氏菌血清病毒的初步血清定型.
- 提供了一种全面的方法,在一次运行中识别多种由食物引起的威胁.
结论:
- NGS为食品传播病原体监测提供了一个强大的,非向的替代方案.
- 这种方法通过确保更广泛的检测能力来提高食品安全.
- 描述的协议有助于有效和同时识别和初步表征关键的食源性病原体.
